如果企业收到了不合规的发票，可以采取以下措施：

退回发票：如果发现发票存在问题或者不符合要求，应当及时联系销售方并要求重新开具或换开发票。如果无法联系到销售方或者销售方拒绝配合，可以向税务部门投诉，寻求帮助。

财务调整：如果发票的开具日期、数量、金额等要素不符合规范，或者与实际业务不符，应当及时进行财务调整，以避免造成后续的麻烦。

加强内部控制和管理：对于收到不合规的发票，企业应当认真总结原因，加强内部控制和管理，防止类似情况再次发生。具体措施包括建立完善的审批流程、加强供应商审核和管理、加强发票的审核和管理等等。

总之，如果企业收到了不合规的发票，应当及时采取有效措施加以解决，以避免因此产生不必要的税务风险和损失。同时，为了防范类似情况再次发生，企业应当加强内部控制和管理，不断提高财务管理水平。