食品经营许可证的申请流程如下：

注册：在当地政务服务网上注册，提交电子材料、网上审核，办理企业（经营户）注册。

申报：注册完成后，在当地政务服务网上在线申报，填写基本信息，点击“材料清单”按要求上传材料，等待审核。

受理：窗口受理人员对符合申请材料齐全、符合法定形式的，出具《受理通知书》；对申请材料不齐全或者不符合法定形式的，出具《补正材料通知书》。不符合受理条件的，出具《不予受理通知书》。

审查：办理人员对申请人的申请材料进行审查，并按照审查意见开展现场核查。

决定：符合法定条件和标准的，决定予以许可，出具《准予行政许可决定书》。不符合法定条件和标准的，不予许可，出具《不予行政许可决定书》。

取证：可通过窗口领取或邮寄送达。

以上流程仅供参考，具体流程可能因各地要求而有所不同，建议咨询相关部门。