自己代理记账和记账公司代理记账的区别主要体现在以下几个方面：

专业性和规范性：记账公司通常配备了多名经验丰富的财务专业人员，他们的专业知识和技能可以满足各种复杂的财务需求。此外，正规的公司往往遵循更高的规范标准，比如开发票、报税等业务，这对企业来说更为规范。

风险性：如果选择个人代理记账，做账报税的专业能力往往无法保证，可能会因为不科学导致一些问题。相比之下，靠谱的代理记账公司会针对自身原因导致的账务处理不正确担负赔偿义务。

费用：一般来说，代理记账公司的服务收费会比个人代理记账更高，因为代理记账公司需要支付员工的工资、其他运营成本。

注册申请变化：如果企业有注册申请变化或个人缴纳社缴人力资源部等方面的规定，代理公司还可以产生相匹配的了解和代办服务，这是个人代理记账无法做到的。

总的来说，虽然自己代理记账可以节省一部分费用，但是记账公司的专业性和规范性更优异，能够为企业提供更全面、高效的服务。